В ходе Великой Отечественной войны создан Центральный штаб партизанского движения.
В марте 1943 года ГШПД был упразднен, но через месяц 17 апреля Постановлением ГКО СССР № 3195сс его вновь восстановили при Ставке ВГК. Из подчинения ГШПД был выведен Украинский штаб партизанского движения.
13 января 1944 года, учитывая, что большинство партизанских отрядов действуют на территории Украинской и Белорусской ССР, которые имеют свои штабы партизанского движения, ГКО СССР решением № 4945сс расформировал ЦШПД.
Тем же решением ГКО передал руководство партизанским движением на ещё оккупированной территории ЦК Компартий республик: УССР, БССР, ЭССР, ЛатССР, ЛитССР, МССР, Карело-Финской ССР и Крымской АССР и обкомам Ленинградской и Калининской областей.
Руководство партизанским движением, основной задачей которого является дезорганизация тыла противника, а именно:
разрушение коммуникационных линий противника (подрыв мостов, порча железнодорожных путей, устройство крушений поездов, нападение на автомобильный и гужевой транспорт противника);
разрушение линий связи (телефон, телеграф, радиостанции);
уничтожение складов — боеприпасов, снаряжения, горючего и продовольствия;
нападение на штабы и другие войсковые учреждения в тылу противника;
уничтожение материальной части на аэродромах противника;
осведомление частей РККА о расположении, численности и передвижениях войск противника.